Le secrétariat scientifique soutient en premier lieu le conseil d’experts sur le plan organisationnel et technique. Il prépare, à l’attention du conseil d’experts, l'évaluation des rapports d’évaluation et rédige les rapports d’appréciation.

Le secrétariat scientifique soutient les organes du SMB dans le développement de méthodologies, le criblage pour la recherche de solutions d’avenir (« horizon screening »), la pré-délimitation des champs d’évaluation et les analyses de faisabilité.